تعتبر مستشفيات جامعة أصفهان من أكبر المستشفيات الجامعية التعليمية والعلاجية، حيث يبلغ عدد الأسرة الإجمالية لهذه المستشفيات قرابة 2500 سرير. مضافا إلى ذلك، أن الجامعة تدير 23 مستشفى في جميع أنحاء محافظة أصفهان. تتخلص رسالة المستشفيات التعليمية للجامعة في تعليم وتثقيف طلاب الطب وطلاب الدراسات العليا، وفقا لأعلى المعايير المهنية، هادفة إلى إعداد الأطباء لممارسة الطب المتمحور حول المريض، وتحديد الأسئلة الأساسية والإجابة عنها في الآليات والوقاية والعلاج، في تقديم الرعاية الصحية وفي العلوم الأساسية.
